Logistiek is het regelen en organiseren van alle geneesmiddelenstromen tegen zo laag mogelijke kosten en gericht op de vraag naar geneesmiddelen in de apotheek.
Hoe de logistiek verloopt in een apotheek is afhankelijk van het logistiek management: het organiseren en plannen van deze geneesmiddelenstromen in combinatie met het gewenste niveau van dienstverlening van leveranciers en apotheek.
De basis voor een goede logistiek wordt gelegd in de planning en organisatie van voorraadbeheer, magazijnbeheer, en het transport van medicijnen naar de patiënten. De logistieke opbouw van een bestelling bepaalt het inkoop- en voorraadsysteem van de apotheek.
Voor een goede logistiek in een apotheek is de inrichting essentieel. De locatie van bijvoorbeeld aanschrijfplaatsen, afhaalbalie, voorraadruimten speelt een belangrijke rol. De inrichting van de apotheek kán de logistiek vereenvoudigen door de manier van indelen te veranderen. Dit wordt de grondvorm van de logistiek genoemd.